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Une méthode d’analyse d’image automatique pour quantifier rapidement les nombres d’œufs et les taux de parasitisme chez Trichogramma sp.

Résumé

Nous présentons ici une méthode simple et pratique de comptage automatique permettant de dénombrer des œufs et quantifier le taux de parasitisme chez les parasitoïdes oophages, en particulier ceux du genre Trichogramma. La méthode repose sur l’analyse d’images en couleurs, combinant analyse discriminante et segmentation, afin d’être adaptable à tout type d’images. Elle prend la forme d’un « plugin » pour le logiciel ImageJ/ FIJI, appelé CODICOUNT, facilement utilisable et disponible librement. Nous illustrons pas à pas la mise en œuvre de la méthode et évaluons sa performance. Notre méthode apporte à l’opérateur un gain de rapidité et une plus grande fiabilité des comptages lors des élevages et des expérimentations avec les trichogrammes, permettant ainsi de produire des données plus riches et/ou plus nombreuses. La méthode peut aussi être étendue à d’autres applications, en entomologie et au-delà.

Auteurs


Guy Perez

guy.perez@inra.fr

Affiliation : Institut Sophia Agrobiotech, INRA-CNRS-UCA, 06900 Sophia Antipolis, France

Pays : France


Victor Burte

Affiliation : Institut Sophia Agrobiotech, INRA-CNRS-UCA, 06900 Sophia Antipolis, France

Pays : France


Olga Baron

Affiliation : Institut Sophia Agrobiotech, INRA-CNRS-UCA, 06900 Sophia Antipolis, France

Pays : France


Vincent Calcagno

https://orcid.org/0000-0002-5781-967X

Affiliation : Institut Sophia Agrobiotech, INRA-CNRS-UCA, 06900 Sophia Antipolis, France

Pays : France

Pièces jointes

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