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PHENOPSIS: Quelles évolutions technologiques du premier automate de phénotypage des plantes?

Abstract

Afin de répondre aux besoins de phénotypage à haut débit dans le domaine végétal, le LEPSE (Laboratoire d’Ecophysiologie des plantes sous stress environnementaux) et la société Optimalog ont mis au point dès 2002 PHENOPSIS, un des premiers automates de phénotypage des plantes pour cultiver et suivre la croissance en pots de centaines de plantes de l’espèce modèle Arabidopsis thaliana et ce à des niveaux de déficit hydrique du sol contrôlés. Depuis, PHENOPSIS a été utilisé comme outil de phénotypage dans plusieurs dizaines de publications. En parallèle, l’outil a évolué à la demande des utilisateurs pour élargir la gamme de mesures phénotypiques, accroître la sécurité des utilisateurs et améliorer la traçabilité et la fiabilité des données. Cet article fait le point sur ces évolutions.

Authors


Myriam Dauzat

myriam.dauzat@supagro.inra.fr

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


Anaëlle Dambreville

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


Justine Bresson

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France; Geschwister-Scholl-Platz, 72074, Tübingen, Germany

Country : France


Denis Vile

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


Bertrand Muller

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


Vincent Nègre

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


Garance Koch

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


François Vasseur

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France; CEFE, 1919, Route de Mende, 34090 Montpellier, France

Country : France


Alexis Bédiée

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France


Maxence Desigaux

Affiliation : OPTIMALOG, SARL, 2 rue de la Fontaine de Mié, 37540 Saint Cyr sur Loire, France

Country : France


Denis Fourré

Affiliation : OPTIMALOG, SARL, 2 rue de la Fontaine de Mié, 37540 Saint Cyr sur Loire, France

Country : France


Christine Granier

Affiliation : INRA-LEPSE, 2 place Viala ,34060 Montpellier cedex, France

Country : France

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