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Evaluation de l'effet de la conservation du matériel végétal sur la quantité et la qualité de l'ADN, en vue de la mise en place d'une politique de gestion du stockage des échantillons

Résumé

L’URFM stocke plus de 40 000 échantillons végétaux soit à -20°C soit à température ambiante après déshydratation. Le projet présenté dans cet article a eu pour but d’évaluer la quantité et la qualité de l’ADN obtenu à partir d’échantillons de quatre espèces d’arbres méditerranéens. Pour mesurer la qualité de l’ADN, nous avons effectué des analyses de génotypage et de séquençage couramment utilisées au laboratoire. Nos résultats montrent une variation entre les quatre espèces étudiées en fonction du mode et de la durée de conservation sur la quantité et la qualité de l’ADN. De plus, nous avons montré que les échantillons conservés sur la plus longue période ou avec la méthode la plus basique (à sec) ne sont pas ceux qui présentent la moins bonne qualité d’ADN.

Auteurs


Matthieu Lingrand

matthieu.lingrand@inrae.fr

Affiliation : INRAE, UR629 Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Domaine Saint Paul, Site Agroparc, FR-84914 Avignon Cedex 9, France

Pays : France


Caroline Scotti-Saintagne

https://orcid.org/0000-0001-6891-7315

Affiliation : INRAE, UR629 Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Domaine Saint Paul, Site Agroparc, FR-84914 Avignon Cedex 9, France

Pays : France


Sylvie Oddou-Muratorio

https://orcid.org/0000-0003-2374-8313

Affiliation : INRAE, UR629 Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Domaine Saint Paul, Site Agroparc, FR-84914 Avignon Cedex 9, France

Pays : France


Marianne Correard

Affiliation : INRAE, UE0348 Unité Expérimentale Entomologie et Forêt Méditerranéenne. INRA-UEFM Domaine Saint Paul, Site Agroparc 84914 Avignon, France

Pays : France


Olivier Gilg

https://orcid.org/0000-0002-9083-4492

Affiliation : INRAE, UE0348 Unité Expérimentale Entomologie et Forêt Méditerranéenne. INRA-UEFM Domaine Saint Paul, Site Agroparc 84914 Avignon, France

Pays : France


Franck Reï

Affiliation : INRAE, UE0348 Unité Expérimentale Entomologie et Forêt Méditerranéenne. INRA-UEFM Domaine Saint Paul, Site Agroparc 84914 Avignon, France

Pays : France


Anne Roig

Affiliation : INRAE, UR629 Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Domaine Saint Paul, Site Agroparc, FR-84914 Avignon Cedex 9, France

Pays : France


Patrice Brahic

Affiliation : Office National des Forêts, Pôle National des Ressources Génétiques Forestières, Route du barrage 13115 Saint Paul Lez Durance, France

Pays : France

Pièces jointes

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